Protein–RNA interactions for Protein: G3X9M3

Hmgxb3, HMG box domain-containing 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgxb3G3X9M3 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms