Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srp72F8VQC1 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srp72F8VQC1 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srp72F8VQC1 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srp72F8VQC1 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srp72F8VQC1 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srp72F8VQC1 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srp72F8VQC1 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srp72F8VQC1 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Srp72F8VQC1 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Srp72F8VQC1 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srp72F8VQC1 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srp72F8VQC1 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srp72F8VQC1 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srp72F8VQC1 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srp72F8VQC1 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srp72F8VQC1 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srp72F8VQC1 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srp72F8VQC1 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srp72F8VQC1 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srp72F8VQC1 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srp72F8VQC1 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srp72F8VQC1 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srp72F8VQC1 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srp72F8VQC1 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srp72F8VQC1 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srp72F8VQC1 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srp72F8VQC1 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srp72F8VQC1 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srp72F8VQC1 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srp72F8VQC1 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srp72F8VQC1 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srp72F8VQC1 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srp72F8VQC1 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srp72F8VQC1 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srp72F8VQC1 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srp72F8VQC1 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srp72F8VQC1 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srp72F8VQC1 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srp72F8VQC1 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srp72F8VQC1 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srp72F8VQC1 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srp72F8VQC1 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srp72F8VQC1 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srp72F8VQC1 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srp72F8VQC1 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srp72F8VQC1 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srp72F8VQC1 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srp72F8VQC1 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srp72F8VQC1 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srp72F8VQC1 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srp72F8VQC1 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srp72F8VQC1 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srp72F8VQC1 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srp72F8VQC1 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srp72F8VQC1 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srp72F8VQC1 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srp72F8VQC1 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srp72F8VQC1 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srp72F8VQC1 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Srp72F8VQC1 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srp72F8VQC1 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Srp72F8VQC1 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srp72F8VQC1 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srp72F8VQC1 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srp72F8VQC1 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srp72F8VQC1 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srp72F8VQC1 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Srp72F8VQC1 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Srp72F8VQC1 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Srp72F8VQC1 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Srp72F8VQC1 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Srp72F8VQC1 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Srp72F8VQC1 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Srp72F8VQC1 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Srp72F8VQC1 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Srp72F8VQC1 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Srp72F8VQC1 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Srp72F8VQC1 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Srp72F8VQC1 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Srp72F8VQC1 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Srp72F8VQC1 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Srp72F8VQC1 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Srp72F8VQC1 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Srp72F8VQC1 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Srp72F8VQC1 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Srp72F8VQC1 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Srp72F8VQC1 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Srp72F8VQC1 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Srp72F8VQC1 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Srp72F8VQC1 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Srp72F8VQC1 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Srp72F8VQC1 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Srp72F8VQC1 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Srp72F8VQC1 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Srp72F8VQC1 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Srp72F8VQC1 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Srp72F8VQC1 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Srp72F8VQC1 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Srp72F8VQC1 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms