Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Farp1F8VPU2 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Farp1F8VPU2 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Farp1F8VPU2 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Farp1F8VPU2 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Farp1F8VPU2 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Farp1F8VPU2 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Farp1F8VPU2 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Farp1F8VPU2 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Farp1F8VPU2 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Farp1F8VPU2 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Farp1F8VPU2 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Farp1F8VPU2 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Farp1F8VPU2 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Farp1F8VPU2 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Farp1F8VPU2 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Farp1F8VPU2 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Farp1F8VPU2 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Farp1F8VPU2 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Farp1F8VPU2 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Farp1F8VPU2 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Farp1F8VPU2 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Farp1F8VPU2 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Farp1F8VPU2 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Farp1F8VPU2 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Farp1F8VPU2 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Farp1F8VPU2 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Farp1F8VPU2 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Farp1F8VPU2 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Farp1F8VPU2 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Farp1F8VPU2 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Farp1F8VPU2 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Farp1F8VPU2 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Farp1F8VPU2 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Farp1F8VPU2 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Farp1F8VPU2 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Farp1F8VPU2 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Farp1F8VPU2 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Farp1F8VPU2 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Farp1F8VPU2 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Farp1F8VPU2 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Farp1F8VPU2 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Farp1F8VPU2 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Farp1F8VPU2 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Farp1F8VPU2 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Farp1F8VPU2 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Farp1F8VPU2 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Farp1F8VPU2 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Farp1F8VPU2 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Farp1F8VPU2 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Farp1F8VPU2 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Farp1F8VPU2 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Farp1F8VPU2 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Farp1F8VPU2 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Farp1F8VPU2 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Farp1F8VPU2 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Farp1F8VPU2 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Farp1F8VPU2 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Farp1F8VPU2 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Farp1F8VPU2 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Farp1F8VPU2 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Farp1F8VPU2 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Farp1F8VPU2 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Farp1F8VPU2 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Farp1F8VPU2 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Farp1F8VPU2 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Farp1F8VPU2 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Farp1F8VPU2 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Vmn1r207-ps-201ENSMUST00000119931 1073 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms