Protein–RNA interactions for Protein: F8VPK8

Pcdh9, Protocadherin 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh9F8VPK8 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcdh9F8VPK8 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcdh9F8VPK8 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcdh9F8VPK8 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcdh9F8VPK8 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcdh9F8VPK8 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcdh9F8VPK8 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcdh9F8VPK8 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcdh9F8VPK8 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcdh9F8VPK8 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcdh9F8VPK8 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcdh9F8VPK8 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcdh9F8VPK8 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcdh9F8VPK8 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Pcdh9F8VPK8 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcdh9F8VPK8 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcdh9F8VPK8 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcdh9F8VPK8 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcdh9F8VPK8 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcdh9F8VPK8 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcdh9F8VPK8 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcdh9F8VPK8 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcdh9F8VPK8 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcdh9F8VPK8 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Pcdh9F8VPK8 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pcdh9F8VPK8 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcdh9F8VPK8 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcdh9F8VPK8 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcdh9F8VPK8 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcdh9F8VPK8 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pcdh9F8VPK8 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pcdh9F8VPK8 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcdh9F8VPK8 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcdh9F8VPK8 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pcdh9F8VPK8 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pcdh9F8VPK8 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pcdh9F8VPK8 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcdh9F8VPK8 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcdh9F8VPK8 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pcdh9F8VPK8 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcdh9F8VPK8 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcdh9F8VPK8 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcdh9F8VPK8 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcdh9F8VPK8 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcdh9F8VPK8 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcdh9F8VPK8 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcdh9F8VPK8 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcdh9F8VPK8 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcdh9F8VPK8 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcdh9F8VPK8 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcdh9F8VPK8 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcdh9F8VPK8 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcdh9F8VPK8 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcdh9F8VPK8 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcdh9F8VPK8 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcdh9F8VPK8 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcdh9F8VPK8 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcdh9F8VPK8 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcdh9F8VPK8 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcdh9F8VPK8 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcdh9F8VPK8 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcdh9F8VPK8 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcdh9F8VPK8 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcdh9F8VPK8 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcdh9F8VPK8 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcdh9F8VPK8 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcdh9F8VPK8 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcdh9F8VPK8 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcdh9F8VPK8 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcdh9F8VPK8 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcdh9F8VPK8 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcdh9F8VPK8 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcdh9F8VPK8 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcdh9F8VPK8 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcdh9F8VPK8 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcdh9F8VPK8 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcdh9F8VPK8 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcdh9F8VPK8 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcdh9F8VPK8 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcdh9F8VPK8 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcdh9F8VPK8 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcdh9F8VPK8 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcdh9F8VPK8 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcdh9F8VPK8 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcdh9F8VPK8 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcdh9F8VPK8 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcdh9F8VPK8 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcdh9F8VPK8 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcdh9F8VPK8 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcdh9F8VPK8 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcdh9F8VPK8 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcdh9F8VPK8 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcdh9F8VPK8 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcdh9F8VPK8 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcdh9F8VPK8 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcdh9F8VPK8 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcdh9F8VPK8 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcdh9F8VPK8 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcdh9F8VPK8 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcdh9F8VPK8 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms