Protein–RNA interactions for Protein: F7CQW8

Gm3371, Predicted gene 3371 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3371F7CQW8 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm3371F7CQW8 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm3371F7CQW8 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm3371F7CQW8 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm3371F7CQW8 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm3371F7CQW8 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm3371F7CQW8 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm3371F7CQW8 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm3371F7CQW8 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm3371F7CQW8 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm3371F7CQW8 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm3371F7CQW8 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm3371F7CQW8 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm3371F7CQW8 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm3371F7CQW8 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm3371F7CQW8 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm3371F7CQW8 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm3371F7CQW8 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm3371F7CQW8 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm3371F7CQW8 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm3371F7CQW8 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm3371F7CQW8 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm3371F7CQW8 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm3371F7CQW8 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm3371F7CQW8 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm3371F7CQW8 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms