Protein–RNA interactions for Protein: F6SG70

Gm28374, Predicted gene 28374 (Fragment), mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28374F6SG70 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Gm27227-201ENSMUST00000183413 633 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Gm20834-202ENSMUST00000185576 1220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Gm9723-201ENSMUST00000192100 457 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Gm42726-201ENSMUST00000202274 1286 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Tbata-209ENSMUST00000148181 1017 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 9330118I20Rik-201ENSMUST00000203390 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Prl6a1-201ENSMUST00000091679 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Prl6a1-202ENSMUST00000091680 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm28374F6SG70 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm28374F6SG70 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm28374F6SG70 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm28374F6SG70 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm28374F6SG70 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28374F6SG70 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28374F6SG70 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28374F6SG70 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28374F6SG70 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28374F6SG70 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28374F6SG70 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28374F6SG70 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28374F6SG70 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28374F6SG70 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28374F6SG70 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28374F6SG70 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28374F6SG70 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28374F6SG70 Gm13333-201ENSMUST00000119424 781 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28374F6SG70 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28374F6SG70 Atp6v1c2-207ENSMUST00000156727 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28374F6SG70 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28374F6SG70 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28374F6SG70 Gm36943-201ENSMUST00000194422 282 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28374F6SG70 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28374F6SG70 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28374F6SG70 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28374F6SG70 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28374F6SG70 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28374F6SG70 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28374F6SG70 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28374F6SG70 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28374F6SG70 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28374F6SG70 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28374F6SG70 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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