Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms