Protein–RNA interactions for Protein: F2Z461

Herc6, E3 ISG15--protein ligase Herc6, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc6F2Z461 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms