Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9U0

Usp17lb, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein B, mousemouse

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17lbE9Q9U0 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp17lbE9Q9U0 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp17lbE9Q9U0 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp17lbE9Q9U0 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp17lbE9Q9U0 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp17lbE9Q9U0 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp17lbE9Q9U0 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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Usp17lbE9Q9U0 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp17lbE9Q9U0 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp17lbE9Q9U0 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp17lbE9Q9U0 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp17lbE9Q9U0 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp17lbE9Q9U0 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp17lbE9Q9U0 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp17lbE9Q9U0 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp17lbE9Q9U0 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp17lbE9Q9U0 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp17lbE9Q9U0 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp17lbE9Q9U0 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp17lbE9Q9U0 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp17lbE9Q9U0 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp17lbE9Q9U0 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp17lbE9Q9U0 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp17lbE9Q9U0 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp17lbE9Q9U0 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp17lbE9Q9U0 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp17lbE9Q9U0 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp17lbE9Q9U0 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp17lbE9Q9U0 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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Usp17lbE9Q9U0 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp17lbE9Q9U0 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp17lbE9Q9U0 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp17lbE9Q9U0 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp17lbE9Q9U0 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
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Usp17lbE9Q9U0 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp17lbE9Q9U0 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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Usp17lbE9Q9U0 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
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Usp17lbE9Q9U0 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp17lbE9Q9U0 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp17lbE9Q9U0 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp17lbE9Q9U0 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp17lbE9Q9U0 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp17lbE9Q9U0 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp17lbE9Q9U0 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp17lbE9Q9U0 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp17lbE9Q9U0 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp17lbE9Q9U0 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp17lbE9Q9U0 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp17lbE9Q9U0 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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Usp17lbE9Q9U0 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp17lbE9Q9U0 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp17lbE9Q9U0 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp17lbE9Q9U0 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp17lbE9Q9U0 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms