Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9K5

Trdn, Triadin, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrdnE9Q9K5 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TrdnE9Q9K5 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TrdnE9Q9K5 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
TrdnE9Q9K5 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
TrdnE9Q9K5 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TrdnE9Q9K5 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TrdnE9Q9K5 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TrdnE9Q9K5 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TrdnE9Q9K5 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TrdnE9Q9K5 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TrdnE9Q9K5 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TrdnE9Q9K5 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TrdnE9Q9K5 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TrdnE9Q9K5 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TrdnE9Q9K5 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TrdnE9Q9K5 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TrdnE9Q9K5 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TrdnE9Q9K5 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TrdnE9Q9K5 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TrdnE9Q9K5 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TrdnE9Q9K5 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TrdnE9Q9K5 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TrdnE9Q9K5 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TrdnE9Q9K5 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TrdnE9Q9K5 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TrdnE9Q9K5 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TrdnE9Q9K5 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TrdnE9Q9K5 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TrdnE9Q9K5 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TrdnE9Q9K5 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TrdnE9Q9K5 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TrdnE9Q9K5 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TrdnE9Q9K5 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TrdnE9Q9K5 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TrdnE9Q9K5 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TrdnE9Q9K5 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TrdnE9Q9K5 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TrdnE9Q9K5 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TrdnE9Q9K5 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TrdnE9Q9K5 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TrdnE9Q9K5 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TrdnE9Q9K5 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TrdnE9Q9K5 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TrdnE9Q9K5 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TrdnE9Q9K5 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TrdnE9Q9K5 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TrdnE9Q9K5 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TrdnE9Q9K5 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TrdnE9Q9K5 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TrdnE9Q9K5 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TrdnE9Q9K5 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TrdnE9Q9K5 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TrdnE9Q9K5 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TrdnE9Q9K5 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TrdnE9Q9K5 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TrdnE9Q9K5 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TrdnE9Q9K5 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TrdnE9Q9K5 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TrdnE9Q9K5 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TrdnE9Q9K5 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TrdnE9Q9K5 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TrdnE9Q9K5 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TrdnE9Q9K5 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TrdnE9Q9K5 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TrdnE9Q9K5 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TrdnE9Q9K5 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TrdnE9Q9K5 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TrdnE9Q9K5 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TrdnE9Q9K5 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TrdnE9Q9K5 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TrdnE9Q9K5 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TrdnE9Q9K5 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TrdnE9Q9K5 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TrdnE9Q9K5 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TrdnE9Q9K5 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TrdnE9Q9K5 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TrdnE9Q9K5 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TrdnE9Q9K5 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TrdnE9Q9K5 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TrdnE9Q9K5 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TrdnE9Q9K5 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TrdnE9Q9K5 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TrdnE9Q9K5 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TrdnE9Q9K5 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TrdnE9Q9K5 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TrdnE9Q9K5 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TrdnE9Q9K5 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TrdnE9Q9K5 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TrdnE9Q9K5 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TrdnE9Q9K5 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TrdnE9Q9K5 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TrdnE9Q9K5 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TrdnE9Q9K5 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TrdnE9Q9K5 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TrdnE9Q9K5 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TrdnE9Q9K5 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TrdnE9Q9K5 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TrdnE9Q9K5 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TrdnE9Q9K5 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TrdnE9Q9K5 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms