Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Urb2E9Q7L1 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Urb2E9Q7L1 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Urb2E9Q7L1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Urb2E9Q7L1 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Urb2E9Q7L1 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Urb2E9Q7L1 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Urb2E9Q7L1 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Urb2E9Q7L1 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Urb2E9Q7L1 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Urb2E9Q7L1 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Urb2E9Q7L1 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Urb2E9Q7L1 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Urb2E9Q7L1 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Urb2E9Q7L1 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Urb2E9Q7L1 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Urb2E9Q7L1 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Urb2E9Q7L1 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Urb2E9Q7L1 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Urb2E9Q7L1 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Urb2E9Q7L1 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Urb2E9Q7L1 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Urb2E9Q7L1 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Urb2E9Q7L1 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Urb2E9Q7L1 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Urb2E9Q7L1 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Urb2E9Q7L1 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Urb2E9Q7L1 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Urb2E9Q7L1 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Urb2E9Q7L1 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Urb2E9Q7L1 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Urb2E9Q7L1 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Urb2E9Q7L1 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Urb2E9Q7L1 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Urb2E9Q7L1 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Urb2E9Q7L1 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Urb2E9Q7L1 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Urb2E9Q7L1 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Urb2E9Q7L1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Urb2E9Q7L1 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Urb2E9Q7L1 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Urb2E9Q7L1 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Urb2E9Q7L1 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Urb2E9Q7L1 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Urb2E9Q7L1 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Urb2E9Q7L1 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Urb2E9Q7L1 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Urb2E9Q7L1 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Urb2E9Q7L1 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Urb2E9Q7L1 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Urb2E9Q7L1 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Urb2E9Q7L1 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Urb2E9Q7L1 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Urb2E9Q7L1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Urb2E9Q7L1 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Urb2E9Q7L1 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Urb2E9Q7L1 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Urb2E9Q7L1 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Urb2E9Q7L1 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Urb2E9Q7L1 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Urb2E9Q7L1 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Urb2E9Q7L1 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Urb2E9Q7L1 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Urb2E9Q7L1 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Urb2E9Q7L1 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Urb2E9Q7L1 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Urb2E9Q7L1 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Urb2E9Q7L1 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Urb2E9Q7L1 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Urb2E9Q7L1 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Urb2E9Q7L1 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Urb2E9Q7L1 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Urb2E9Q7L1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Urb2E9Q7L1 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Urb2E9Q7L1 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Urb2E9Q7L1 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Urb2E9Q7L1 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Urb2E9Q7L1 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Urb2E9Q7L1 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Urb2E9Q7L1 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Urb2E9Q7L1 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Urb2E9Q7L1 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Urb2E9Q7L1 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Urb2E9Q7L1 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Urb2E9Q7L1 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Urb2E9Q7L1 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Urb2E9Q7L1 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Urb2E9Q7L1 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Urb2E9Q7L1 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Urb2E9Q7L1 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Urb2E9Q7L1 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Urb2E9Q7L1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Urb2E9Q7L1 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Urb2E9Q7L1 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Urb2E9Q7L1 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Urb2E9Q7L1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Urb2E9Q7L1 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Urb2E9Q7L1 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Urb2E9Q7L1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Urb2E9Q7L1 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms