Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7E4

Gm8882, Predicted gene 8882, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8882E9Q7E4 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm8882E9Q7E4 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm8882E9Q7E4 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm8882E9Q7E4 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm8882E9Q7E4 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm8882E9Q7E4 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm8882E9Q7E4 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm8882E9Q7E4 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm8882E9Q7E4 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm8882E9Q7E4 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm8882E9Q7E4 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm8882E9Q7E4 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm8882E9Q7E4 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm8882E9Q7E4 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm8882E9Q7E4 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm8882E9Q7E4 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm8882E9Q7E4 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm8882E9Q7E4 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm8882E9Q7E4 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm8882E9Q7E4 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm8882E9Q7E4 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm8882E9Q7E4 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm8882E9Q7E4 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm8882E9Q7E4 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm8882E9Q7E4 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm8882E9Q7E4 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm8882E9Q7E4 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm8882E9Q7E4 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8882E9Q7E4 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8882E9Q7E4 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8882E9Q7E4 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8882E9Q7E4 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8882E9Q7E4 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8882E9Q7E4 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8882E9Q7E4 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8882E9Q7E4 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8882E9Q7E4 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8882E9Q7E4 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8882E9Q7E4 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8882E9Q7E4 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8882E9Q7E4 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8882E9Q7E4 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8882E9Q7E4 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8882E9Q7E4 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8882E9Q7E4 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8882E9Q7E4 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8882E9Q7E4 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8882E9Q7E4 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8882E9Q7E4 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8882E9Q7E4 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8882E9Q7E4 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8882E9Q7E4 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm8882E9Q7E4 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm8882E9Q7E4 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm8882E9Q7E4 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm8882E9Q7E4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm8882E9Q7E4 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm8882E9Q7E4 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm8882E9Q7E4 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm8882E9Q7E4 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm8882E9Q7E4 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm8882E9Q7E4 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm8882E9Q7E4 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm8882E9Q7E4 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm8882E9Q7E4 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm8882E9Q7E4 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm8882E9Q7E4 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm8882E9Q7E4 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm8882E9Q7E4 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm8882E9Q7E4 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm8882E9Q7E4 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm8882E9Q7E4 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm8882E9Q7E4 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm8882E9Q7E4 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm8882E9Q7E4 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm8882E9Q7E4 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm8882E9Q7E4 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm8882E9Q7E4 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm8882E9Q7E4 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm8882E9Q7E4 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm8882E9Q7E4 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm8882E9Q7E4 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm8882E9Q7E4 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm8882E9Q7E4 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm8882E9Q7E4 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm8882E9Q7E4 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm8882E9Q7E4 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm8882E9Q7E4 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm8882E9Q7E4 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm8882E9Q7E4 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm8882E9Q7E4 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm8882E9Q7E4 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm8882E9Q7E4 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm8882E9Q7E4 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm8882E9Q7E4 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm8882E9Q7E4 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm8882E9Q7E4 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm8882E9Q7E4 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm8882E9Q7E4 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm8882E9Q7E4 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms