Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6B2

Ccdc85c, Coiled-coil domain-containing protein 85C, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85cE9Q6B2 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ccdc85cE9Q6B2 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ccdc85cE9Q6B2 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc85cE9Q6B2 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc85cE9Q6B2 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc85cE9Q6B2 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc85cE9Q6B2 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc85cE9Q6B2 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc85cE9Q6B2 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc85cE9Q6B2 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc85cE9Q6B2 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc85cE9Q6B2 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc85cE9Q6B2 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc85cE9Q6B2 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc85cE9Q6B2 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc85cE9Q6B2 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc85cE9Q6B2 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc85cE9Q6B2 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc85cE9Q6B2 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc85cE9Q6B2 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc85cE9Q6B2 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc85cE9Q6B2 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc85cE9Q6B2 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc85cE9Q6B2 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc85cE9Q6B2 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc85cE9Q6B2 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc85cE9Q6B2 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc85cE9Q6B2 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc85cE9Q6B2 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc85cE9Q6B2 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc85cE9Q6B2 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc85cE9Q6B2 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc85cE9Q6B2 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc85cE9Q6B2 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc85cE9Q6B2 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc85cE9Q6B2 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc85cE9Q6B2 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc85cE9Q6B2 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc85cE9Q6B2 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc85cE9Q6B2 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc85cE9Q6B2 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc85cE9Q6B2 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc85cE9Q6B2 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc85cE9Q6B2 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc85cE9Q6B2 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc85cE9Q6B2 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc85cE9Q6B2 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc85cE9Q6B2 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc85cE9Q6B2 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc85cE9Q6B2 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc85cE9Q6B2 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc85cE9Q6B2 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc85cE9Q6B2 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc85cE9Q6B2 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc85cE9Q6B2 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc85cE9Q6B2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc85cE9Q6B2 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc85cE9Q6B2 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc85cE9Q6B2 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc85cE9Q6B2 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc85cE9Q6B2 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc85cE9Q6B2 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc85cE9Q6B2 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc85cE9Q6B2 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc85cE9Q6B2 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc85cE9Q6B2 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc85cE9Q6B2 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc85cE9Q6B2 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc85cE9Q6B2 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc85cE9Q6B2 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc85cE9Q6B2 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc85cE9Q6B2 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc85cE9Q6B2 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc85cE9Q6B2 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc85cE9Q6B2 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc85cE9Q6B2 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc85cE9Q6B2 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc85cE9Q6B2 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc85cE9Q6B2 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc85cE9Q6B2 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc85cE9Q6B2 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc85cE9Q6B2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc85cE9Q6B2 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc85cE9Q6B2 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc85cE9Q6B2 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc85cE9Q6B2 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc85cE9Q6B2 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc85cE9Q6B2 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc85cE9Q6B2 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc85cE9Q6B2 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc85cE9Q6B2 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc85cE9Q6B2 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc85cE9Q6B2 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc85cE9Q6B2 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc85cE9Q6B2 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc85cE9Q6B2 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc85cE9Q6B2 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc85cE9Q6B2 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc85cE9Q6B2 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc85cE9Q6B2 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms