Protein–RNA interactions for Protein: E9Q557

Dsp, Desmoplakin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,883 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DspE9Q557 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
DspE9Q557 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
DspE9Q557 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
DspE9Q557 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
DspE9Q557 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
DspE9Q557 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
DspE9Q557 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
DspE9Q557 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
DspE9Q557 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DspE9Q557 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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