Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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