Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms