Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Fndc1E9Q043 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Fndc1E9Q043 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fndc1E9Q043 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fndc1E9Q043 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Fndc1E9Q043 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fndc1E9Q043 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fndc1E9Q043 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fndc1E9Q043 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fndc1E9Q043 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fndc1E9Q043 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fndc1E9Q043 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fndc1E9Q043 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fndc1E9Q043 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Fndc1E9Q043 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Fndc1E9Q043 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Fndc1E9Q043 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fndc1E9Q043 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fndc1E9Q043 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Fndc1E9Q043 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fndc1E9Q043 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Fndc1E9Q043 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fndc1E9Q043 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fndc1E9Q043 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fndc1E9Q043 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fndc1E9Q043 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fndc1E9Q043 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fndc1E9Q043 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Fndc1E9Q043 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Fndc1E9Q043 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fndc1E9Q043 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fndc1E9Q043 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fndc1E9Q043 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fndc1E9Q043 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fndc1E9Q043 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fndc1E9Q043 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fndc1E9Q043 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Fndc1E9Q043 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fndc1E9Q043 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fndc1E9Q043 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Fndc1E9Q043 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Fndc1E9Q043 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fndc1E9Q043 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fndc1E9Q043 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fndc1E9Q043 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fndc1E9Q043 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fndc1E9Q043 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fndc1E9Q043 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fndc1E9Q043 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Fndc1E9Q043 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Fndc1E9Q043 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fndc1E9Q043 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fndc1E9Q043 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fndc1E9Q043 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fndc1E9Q043 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fndc1E9Q043 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fndc1E9Q043 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Fndc1E9Q043 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fndc1E9Q043 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fndc1E9Q043 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fndc1E9Q043 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fndc1E9Q043 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fndc1E9Q043 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fndc1E9Q043 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fndc1E9Q043 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fndc1E9Q043 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fndc1E9Q043 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fndc1E9Q043 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fndc1E9Q043 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Fndc1E9Q043 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fndc1E9Q043 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Fndc1E9Q043 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fndc1E9Q043 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fndc1E9Q043 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fndc1E9Q043 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fndc1E9Q043 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fndc1E9Q043 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fndc1E9Q043 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fndc1E9Q043 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fndc1E9Q043 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fndc1E9Q043 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fndc1E9Q043 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fndc1E9Q043 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fndc1E9Q043 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fndc1E9Q043 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Fndc1E9Q043 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fndc1E9Q043 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fndc1E9Q043 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fndc1E9Q043 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fndc1E9Q043 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fndc1E9Q043 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fndc1E9Q043 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fndc1E9Q043 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fndc1E9Q043 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fndc1E9Q043 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fndc1E9Q043 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fndc1E9Q043 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Fndc1E9Q043 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Fndc1E9Q043 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fndc1E9Q043 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms