Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rsph10bE9PYQ0 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rsph10bE9PYQ0 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rsph10bE9PYQ0 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rsph10bE9PYQ0 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rsph10bE9PYQ0 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rsph10bE9PYQ0 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rsph10bE9PYQ0 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rsph10bE9PYQ0 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rsph10bE9PYQ0 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rsph10bE9PYQ0 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rsph10bE9PYQ0 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rsph10bE9PYQ0 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rsph10bE9PYQ0 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rsph10bE9PYQ0 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rsph10bE9PYQ0 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rsph10bE9PYQ0 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rsph10bE9PYQ0 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rsph10bE9PYQ0 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rsph10bE9PYQ0 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rsph10bE9PYQ0 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rsph10bE9PYQ0 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rsph10bE9PYQ0 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rsph10bE9PYQ0 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rsph10bE9PYQ0 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rsph10bE9PYQ0 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rsph10bE9PYQ0 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rsph10bE9PYQ0 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rsph10bE9PYQ0 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rsph10bE9PYQ0 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rsph10bE9PYQ0 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rsph10bE9PYQ0 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rsph10bE9PYQ0 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Rsph10bE9PYQ0 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rsph10bE9PYQ0 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rsph10bE9PYQ0 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rsph10bE9PYQ0 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rsph10bE9PYQ0 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rsph10bE9PYQ0 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rsph10bE9PYQ0 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Rsph10bE9PYQ0 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rsph10bE9PYQ0 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rsph10bE9PYQ0 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Rsph10bE9PYQ0 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rsph10bE9PYQ0 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Rsph10bE9PYQ0 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rsph10bE9PYQ0 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rsph10bE9PYQ0 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rsph10bE9PYQ0 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rsph10bE9PYQ0 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rsph10bE9PYQ0 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rsph10bE9PYQ0 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rsph10bE9PYQ0 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rsph10bE9PYQ0 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rsph10bE9PYQ0 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rsph10bE9PYQ0 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rsph10bE9PYQ0 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rsph10bE9PYQ0 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rsph10bE9PYQ0 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rsph10bE9PYQ0 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rsph10bE9PYQ0 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rsph10bE9PYQ0 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rsph10bE9PYQ0 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rsph10bE9PYQ0 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rsph10bE9PYQ0 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rsph10bE9PYQ0 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rsph10bE9PYQ0 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rsph10bE9PYQ0 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rsph10bE9PYQ0 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rsph10bE9PYQ0 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Rsph10bE9PYQ0 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rsph10bE9PYQ0 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rsph10bE9PYQ0 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Rsph10bE9PYQ0 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rsph10bE9PYQ0 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rsph10bE9PYQ0 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rsph10bE9PYQ0 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rsph10bE9PYQ0 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rsph10bE9PYQ0 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rsph10bE9PYQ0 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rsph10bE9PYQ0 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rsph10bE9PYQ0 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rsph10bE9PYQ0 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rsph10bE9PYQ0 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rsph10bE9PYQ0 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rsph10bE9PYQ0 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rsph10bE9PYQ0 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rsph10bE9PYQ0 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rsph10bE9PYQ0 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rsph10bE9PYQ0 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rsph10bE9PYQ0 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rsph10bE9PYQ0 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Rsph10bE9PYQ0 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rsph10bE9PYQ0 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Rsph10bE9PYQ0 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rsph10bE9PYQ0 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rsph10bE9PYQ0 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rsph10bE9PYQ0 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rsph10bE9PYQ0 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rsph10bE9PYQ0 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms