Protein–RNA interactions for Protein: E9PW72

Gm3002, Predicted gene 3002, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3002E9PW72 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm3002E9PW72 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm3002E9PW72 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm3002E9PW72 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm3002E9PW72 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm3002E9PW72 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm3002E9PW72 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm3002E9PW72 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3002E9PW72 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3002E9PW72 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3002E9PW72 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3002E9PW72 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3002E9PW72 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3002E9PW72 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3002E9PW72 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3002E9PW72 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3002E9PW72 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3002E9PW72 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3002E9PW72 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3002E9PW72 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3002E9PW72 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3002E9PW72 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3002E9PW72 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3002E9PW72 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3002E9PW72 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3002E9PW72 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3002E9PW72 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3002E9PW72 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3002E9PW72 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3002E9PW72 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3002E9PW72 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3002E9PW72 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3002E9PW72 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3002E9PW72 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3002E9PW72 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3002E9PW72 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3002E9PW72 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3002E9PW72 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3002E9PW72 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3002E9PW72 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3002E9PW72 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3002E9PW72 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3002E9PW72 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3002E9PW72 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3002E9PW72 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3002E9PW72 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3002E9PW72 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3002E9PW72 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3002E9PW72 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3002E9PW72 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3002E9PW72 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3002E9PW72 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3002E9PW72 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3002E9PW72 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3002E9PW72 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3002E9PW72 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3002E9PW72 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3002E9PW72 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3002E9PW72 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3002E9PW72 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3002E9PW72 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3002E9PW72 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3002E9PW72 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3002E9PW72 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3002E9PW72 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3002E9PW72 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3002E9PW72 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3002E9PW72 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3002E9PW72 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3002E9PW72 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3002E9PW72 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3002E9PW72 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3002E9PW72 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3002E9PW72 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3002E9PW72 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3002E9PW72 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3002E9PW72 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3002E9PW72 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms