Protein–RNA interactions for Protein: E9PVL6

Trim30b, Tripartite motif-containing 30B, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30bE9PVL6 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trim30bE9PVL6 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms