Protein–RNA interactions for Protein: E0CZ16

Klhl3, Kelch-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl3E0CZ16 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.6 ms