Protein–RNA interactions for Protein: D3YXE9

BC048679, cDNA sequence BC048679, mousemouse

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Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC048679D3YXE9 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC048679D3YXE9 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC048679D3YXE9 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC048679D3YXE9 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC048679D3YXE9 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC048679D3YXE9 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC048679D3YXE9 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC048679D3YXE9 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC048679D3YXE9 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC048679D3YXE9 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC048679D3YXE9 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC048679D3YXE9 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC048679D3YXE9 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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BC048679D3YXE9 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC048679D3YXE9 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC048679D3YXE9 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC048679D3YXE9 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC048679D3YXE9 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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BC048679D3YXE9 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC048679D3YXE9 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC048679D3YXE9 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC048679D3YXE9 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC048679D3YXE9 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC048679D3YXE9 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC048679D3YXE9 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC048679D3YXE9 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC048679D3YXE9 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC048679D3YXE9 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC048679D3YXE9 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC048679D3YXE9 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC048679D3YXE9 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC048679D3YXE9 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC048679D3YXE9 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC048679D3YXE9 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC048679D3YXE9 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC048679D3YXE9 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC048679D3YXE9 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC048679D3YXE9 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC048679D3YXE9 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC048679D3YXE9 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC048679D3YXE9 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC048679D3YXE9 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC048679D3YXE9 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC048679D3YXE9 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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BC048679D3YXE9 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC048679D3YXE9 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC048679D3YXE9 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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BC048679D3YXE9 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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BC048679D3YXE9 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC048679D3YXE9 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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BC048679D3YXE9 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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BC048679D3YXE9 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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BC048679D3YXE9 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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BC048679D3YXE9 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC048679D3YXE9 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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BC048679D3YXE9 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC048679D3YXE9 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC048679D3YXE9 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC048679D3YXE9 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC048679D3YXE9 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC048679D3YXE9 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC048679D3YXE9 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC048679D3YXE9 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC048679D3YXE9 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC048679D3YXE9 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC048679D3YXE9 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC048679D3YXE9 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC048679D3YXE9 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC048679D3YXE9 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC048679D3YXE9 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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BC048679D3YXE9 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC048679D3YXE9 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC048679D3YXE9 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC048679D3YXE9 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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BC048679D3YXE9 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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