Protein–RNA interactions for Protein: D3YUM8

Gm4950, Proteasome subunit beta type, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4950D3YUM8 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Gm4950D3YUM8 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm4950D3YUM8 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm4950D3YUM8 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm4950D3YUM8 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm4950D3YUM8 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm4950D3YUM8 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm4950D3YUM8 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm4950D3YUM8 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm4950D3YUM8 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm4950D3YUM8 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm4950D3YUM8 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm4950D3YUM8 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm4950D3YUM8 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm4950D3YUM8 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm4950D3YUM8 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm4950D3YUM8 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm4950D3YUM8 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm4950D3YUM8 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm4950D3YUM8 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm4950D3YUM8 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm4950D3YUM8 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm4950D3YUM8 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm4950D3YUM8 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm4950D3YUM8 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm4950D3YUM8 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm4950D3YUM8 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm4950D3YUM8 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm4950D3YUM8 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm4950D3YUM8 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm4950D3YUM8 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm4950D3YUM8 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm4950D3YUM8 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm4950D3YUM8 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm4950D3YUM8 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm4950D3YUM8 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm4950D3YUM8 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm4950D3YUM8 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm4950D3YUM8 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm4950D3YUM8 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm4950D3YUM8 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm4950D3YUM8 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm4950D3YUM8 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm4950D3YUM8 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm4950D3YUM8 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm4950D3YUM8 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm4950D3YUM8 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm4950D3YUM8 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms