Protein–RNA interactions for Protein: C0HKD8

Mfap1a, Microfibrillar-associated protein 1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfap1aC0HKD8 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mfap1aC0HKD8 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mfap1aC0HKD8 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mfap1aC0HKD8 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mfap1aC0HKD8 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mfap1aC0HKD8 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mfap1aC0HKD8 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mfap1aC0HKD8 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mfap1aC0HKD8 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mfap1aC0HKD8 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mfap1aC0HKD8 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mfap1aC0HKD8 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mfap1aC0HKD8 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mfap1aC0HKD8 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mfap1aC0HKD8 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mfap1aC0HKD8 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mfap1aC0HKD8 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mfap1aC0HKD8 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mfap1aC0HKD8 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mfap1aC0HKD8 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mfap1aC0HKD8 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mfap1aC0HKD8 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mfap1aC0HKD8 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mfap1aC0HKD8 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mfap1aC0HKD8 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mfap1aC0HKD8 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mfap1aC0HKD8 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mfap1aC0HKD8 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mfap1aC0HKD8 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mfap1aC0HKD8 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mfap1aC0HKD8 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mfap1aC0HKD8 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mfap1aC0HKD8 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mfap1aC0HKD8 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mfap1aC0HKD8 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mfap1aC0HKD8 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mfap1aC0HKD8 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mfap1aC0HKD8 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mfap1aC0HKD8 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mfap1aC0HKD8 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mfap1aC0HKD8 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mfap1aC0HKD8 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mfap1aC0HKD8 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mfap1aC0HKD8 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mfap1aC0HKD8 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mfap1aC0HKD8 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mfap1aC0HKD8 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mfap1aC0HKD8 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mfap1aC0HKD8 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mfap1aC0HKD8 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mfap1aC0HKD8 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mfap1aC0HKD8 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mfap1aC0HKD8 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mfap1aC0HKD8 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mfap1aC0HKD8 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mfap1aC0HKD8 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mfap1aC0HKD8 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mfap1aC0HKD8 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mfap1aC0HKD8 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mfap1aC0HKD8 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mfap1aC0HKD8 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mfap1aC0HKD8 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mfap1aC0HKD8 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mfap1aC0HKD8 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mfap1aC0HKD8 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mfap1aC0HKD8 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mfap1aC0HKD8 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mfap1aC0HKD8 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mfap1aC0HKD8 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mfap1aC0HKD8 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mfap1aC0HKD8 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mfap1aC0HKD8 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mfap1aC0HKD8 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mfap1aC0HKD8 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mfap1aC0HKD8 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mfap1aC0HKD8 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mfap1aC0HKD8 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Mfap1aC0HKD8 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mfap1aC0HKD8 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mfap1aC0HKD8 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mfap1aC0HKD8 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mfap1aC0HKD8 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Mfap1aC0HKD8 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mfap1aC0HKD8 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mfap1aC0HKD8 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mfap1aC0HKD8 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mfap1aC0HKD8 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mfap1aC0HKD8 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mfap1aC0HKD8 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mfap1aC0HKD8 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mfap1aC0HKD8 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mfap1aC0HKD8 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mfap1aC0HKD8 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mfap1aC0HKD8 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mfap1aC0HKD8 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mfap1aC0HKD8 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mfap1aC0HKD8 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mfap1aC0HKD8 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mfap1aC0HKD8 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mfap1aC0HKD8 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.7 ms