Protein–RNA interactions for Protein: C0HKC9

Smok3b, Sperm motility kinase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smok3bC0HKC9 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms