Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
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Clip3B9EHT4 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Clip3B9EHT4 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Clip3B9EHT4 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clip3B9EHT4 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
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Clip3B9EHT4 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Clip3B9EHT4 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clip3B9EHT4 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clip3B9EHT4 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clip3B9EHT4 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clip3B9EHT4 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clip3B9EHT4 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clip3B9EHT4 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clip3B9EHT4 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clip3B9EHT4 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clip3B9EHT4 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clip3B9EHT4 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clip3B9EHT4 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clip3B9EHT4 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clip3B9EHT4 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clip3B9EHT4 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clip3B9EHT4 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clip3B9EHT4 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clip3B9EHT4 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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