Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms