Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Uhrf1bp1B2KF50 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Uhrf1bp1B2KF50 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Uhrf1bp1B2KF50 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Uhrf1bp1B2KF50 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Uhrf1bp1B2KF50 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Uhrf1bp1B2KF50 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Uhrf1bp1B2KF50 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Uhrf1bp1B2KF50 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Uhrf1bp1B2KF50 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Uhrf1bp1B2KF50 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Uhrf1bp1B2KF50 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Uhrf1bp1B2KF50 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Uhrf1bp1B2KF50 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Uhrf1bp1B2KF50 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Uhrf1bp1B2KF50 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Uhrf1bp1B2KF50 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Uhrf1bp1B2KF50 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Uhrf1bp1B2KF50 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Uhrf1bp1B2KF50 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Uhrf1bp1B2KF50 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Uhrf1bp1B2KF50 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Uhrf1bp1B2KF50 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Uhrf1bp1B2KF50 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Uhrf1bp1B2KF50 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Uhrf1bp1B2KF50 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Uhrf1bp1B2KF50 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Uhrf1bp1B2KF50 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Uhrf1bp1B2KF50 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Uhrf1bp1B2KF50 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Uhrf1bp1B2KF50 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Uhrf1bp1B2KF50 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Uhrf1bp1B2KF50 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Uhrf1bp1B2KF50 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Uhrf1bp1B2KF50 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Uhrf1bp1B2KF50 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Uhrf1bp1B2KF50 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Uhrf1bp1B2KF50 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Uhrf1bp1B2KF50 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Uhrf1bp1B2KF50 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Uhrf1bp1B2KF50 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Uhrf1bp1B2KF50 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Uhrf1bp1B2KF50 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Uhrf1bp1B2KF50 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Uhrf1bp1B2KF50 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Uhrf1bp1B2KF50 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Uhrf1bp1B2KF50 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Uhrf1bp1B2KF50 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Uhrf1bp1B2KF50 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Uhrf1bp1B2KF50 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Uhrf1bp1B2KF50 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Uhrf1bp1B2KF50 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Uhrf1bp1B2KF50 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Uhrf1bp1B2KF50 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Uhrf1bp1B2KF50 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Uhrf1bp1B2KF50 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Uhrf1bp1B2KF50 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Uhrf1bp1B2KF50 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Uhrf1bp1B2KF50 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Uhrf1bp1B2KF50 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Uhrf1bp1B2KF50 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Uhrf1bp1B2KF50 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Uhrf1bp1B2KF50 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Uhrf1bp1B2KF50 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Uhrf1bp1B2KF50 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Uhrf1bp1B2KF50 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Uhrf1bp1B2KF50 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Uhrf1bp1B2KF50 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Uhrf1bp1B2KF50 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Uhrf1bp1B2KF50 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Uhrf1bp1B2KF50 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Uhrf1bp1B2KF50 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Uhrf1bp1B2KF50 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Uhrf1bp1B2KF50 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Uhrf1bp1B2KF50 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Uhrf1bp1B2KF50 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Uhrf1bp1B2KF50 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Uhrf1bp1B2KF50 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Uhrf1bp1B2KF50 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Uhrf1bp1B2KF50 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Uhrf1bp1B2KF50 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Uhrf1bp1B2KF50 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Uhrf1bp1B2KF50 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Uhrf1bp1B2KF50 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Uhrf1bp1B2KF50 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Uhrf1bp1B2KF50 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Uhrf1bp1B2KF50 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Uhrf1bp1B2KF50 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Uhrf1bp1B2KF50 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Uhrf1bp1B2KF50 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Uhrf1bp1B2KF50 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Uhrf1bp1B2KF50 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Uhrf1bp1B2KF50 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Uhrf1bp1B2KF50 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Uhrf1bp1B2KF50 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Uhrf1bp1B2KF50 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Uhrf1bp1B2KF50 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Uhrf1bp1B2KF50 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Uhrf1bp1B2KF50 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms