Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms