Protein–RNA interactions for Protein: A7XUY5

Skint5, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint5A7XUY5 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Skint5A7XUY5 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Skint5A7XUY5 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Skint5A7XUY5 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Skint5A7XUY5 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Skint5A7XUY5 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Skint5A7XUY5 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Skint5A7XUY5 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Skint5A7XUY5 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Skint5A7XUY5 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Skint5A7XUY5 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Skint5A7XUY5 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Skint5A7XUY5 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Skint5A7XUY5 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Skint5A7XUY5 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Skint5A7XUY5 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Skint5A7XUY5 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Skint5A7XUY5 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Skint5A7XUY5 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Skint5A7XUY5 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Skint5A7XUY5 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Skint5A7XUY5 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Skint5A7XUY5 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Skint5A7XUY5 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Skint5A7XUY5 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Skint5A7XUY5 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Skint5A7XUY5 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Skint5A7XUY5 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Skint5A7XUY5 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Skint5A7XUY5 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Skint5A7XUY5 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Skint5A7XUY5 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Skint5A7XUY5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Skint5A7XUY5 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Skint5A7XUY5 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Skint5A7XUY5 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Skint5A7XUY5 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Skint5A7XUY5 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Skint5A7XUY5 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Skint5A7XUY5 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Skint5A7XUY5 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Skint5A7XUY5 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Skint5A7XUY5 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Skint5A7XUY5 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Skint5A7XUY5 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Skint5A7XUY5 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Skint5A7XUY5 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Skint5A7XUY5 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Skint5A7XUY5 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Skint5A7XUY5 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Skint5A7XUY5 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Skint5A7XUY5 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Skint5A7XUY5 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Skint5A7XUY5 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Skint5A7XUY5 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Skint5A7XUY5 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Skint5A7XUY5 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Skint5A7XUY5 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Skint5A7XUY5 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Skint5A7XUY5 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Skint5A7XUY5 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Skint5A7XUY5 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Skint5A7XUY5 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Skint5A7XUY5 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Skint5A7XUY5 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Skint5A7XUY5 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Skint5A7XUY5 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Skint5A7XUY5 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Skint5A7XUY5 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Skint5A7XUY5 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Skint5A7XUY5 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Skint5A7XUY5 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Skint5A7XUY5 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Skint5A7XUY5 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Skint5A7XUY5 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Skint5A7XUY5 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Skint5A7XUY5 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Skint5A7XUY5 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Skint5A7XUY5 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Skint5A7XUY5 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Skint5A7XUY5 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Skint5A7XUY5 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Skint5A7XUY5 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Skint5A7XUY5 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Skint5A7XUY5 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Skint5A7XUY5 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Skint5A7XUY5 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Skint5A7XUY5 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Skint5A7XUY5 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Skint5A7XUY5 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Skint5A7XUY5 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Skint5A7XUY5 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Skint5A7XUY5 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Skint5A7XUY5 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Skint5A7XUY5 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Skint5A7XUY5 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Skint5A7XUY5 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Skint5A7XUY5 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Skint5A7XUY5 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Skint5A7XUY5 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms