Protein–RNA interactions for Protein: A4UUI3

Gbp4, Guanylate binding protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4A4UUI3 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gbp4A4UUI3 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gbp4A4UUI3 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gbp4A4UUI3 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gbp4A4UUI3 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gbp4A4UUI3 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbp4A4UUI3 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbp4A4UUI3 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbp4A4UUI3 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbp4A4UUI3 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbp4A4UUI3 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbp4A4UUI3 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbp4A4UUI3 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbp4A4UUI3 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbp4A4UUI3 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbp4A4UUI3 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbp4A4UUI3 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbp4A4UUI3 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbp4A4UUI3 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbp4A4UUI3 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbp4A4UUI3 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbp4A4UUI3 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbp4A4UUI3 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbp4A4UUI3 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbp4A4UUI3 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbp4A4UUI3 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbp4A4UUI3 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbp4A4UUI3 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbp4A4UUI3 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbp4A4UUI3 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbp4A4UUI3 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbp4A4UUI3 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbp4A4UUI3 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbp4A4UUI3 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbp4A4UUI3 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gbp4A4UUI3 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gbp4A4UUI3 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gbp4A4UUI3 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gbp4A4UUI3 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gbp4A4UUI3 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gbp4A4UUI3 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gbp4A4UUI3 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gbp4A4UUI3 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gbp4A4UUI3 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gbp4A4UUI3 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gbp4A4UUI3 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gbp4A4UUI3 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gbp4A4UUI3 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gbp4A4UUI3 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gbp4A4UUI3 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gbp4A4UUI3 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gbp4A4UUI3 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gbp4A4UUI3 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gbp4A4UUI3 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gbp4A4UUI3 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gbp4A4UUI3 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gbp4A4UUI3 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gbp4A4UUI3 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gbp4A4UUI3 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gbp4A4UUI3 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gbp4A4UUI3 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gbp4A4UUI3 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gbp4A4UUI3 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gbp4A4UUI3 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gbp4A4UUI3 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gbp4A4UUI3 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gbp4A4UUI3 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gbp4A4UUI3 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gbp4A4UUI3 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gbp4A4UUI3 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gbp4A4UUI3 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gbp4A4UUI3 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gbp4A4UUI3 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gbp4A4UUI3 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms