Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms