Protein–RNA interactions for Protein: A2RTF1

Catsperb, Cation channel sperm-associated protein subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatsperbA2RTF1 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms