Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Samt1A2BED8 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Samt1A2BED8 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Samt1A2BED8 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Samt1A2BED8 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Samt1A2BED8 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Samt1A2BED8 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Samt1A2BED8 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Samt1A2BED8 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Samt1A2BED8 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Samt1A2BED8 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Samt1A2BED8 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Samt1A2BED8 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Samt1A2BED8 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Samt1A2BED8 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Samt1A2BED8 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Samt1A2BED8 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Samt1A2BED8 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Samt1A2BED8 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Samt1A2BED8 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Samt1A2BED8 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Samt1A2BED8 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Samt1A2BED8 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Samt1A2BED8 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Samt1A2BED8 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Samt1A2BED8 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Samt1A2BED8 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Samt1A2BED8 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Samt1A2BED8 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Samt1A2BED8 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Samt1A2BED8 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Samt1A2BED8 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Samt1A2BED8 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Samt1A2BED8 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Samt1A2BED8 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Samt1A2BED8 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Samt1A2BED8 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Samt1A2BED8 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Samt1A2BED8 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Samt1A2BED8 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Samt1A2BED8 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Samt1A2BED8 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Samt1A2BED8 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Samt1A2BED8 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Samt1A2BED8 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Samt1A2BED8 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Samt1A2BED8 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Samt1A2BED8 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Samt1A2BED8 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Samt1A2BED8 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Samt1A2BED8 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Samt1A2BED8 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Samt1A2BED8 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Samt1A2BED8 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Samt1A2BED8 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Samt1A2BED8 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Samt1A2BED8 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Samt1A2BED8 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Samt1A2BED8 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Samt1A2BED8 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Samt1A2BED8 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Samt1A2BED8 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Samt1A2BED8 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Samt1A2BED8 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Samt1A2BED8 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Samt1A2BED8 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Samt1A2BED8 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Samt1A2BED8 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Samt1A2BED8 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Samt1A2BED8 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Samt1A2BED8 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Samt1A2BED8 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Samt1A2BED8 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Samt1A2BED8 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Samt1A2BED8 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Samt1A2BED8 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Samt1A2BED8 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Samt1A2BED8 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Samt1A2BED8 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Samt1A2BED8 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Samt1A2BED8 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Samt1A2BED8 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Samt1A2BED8 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Samt1A2BED8 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Samt1A2BED8 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Samt1A2BED8 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Samt1A2BED8 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Samt1A2BED8 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Samt1A2BED8 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Samt1A2BED8 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Samt1A2BED8 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Samt1A2BED8 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Samt1A2BED8 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Samt1A2BED8 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Samt1A2BED8 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Samt1A2BED8 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Samt1A2BED8 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Samt1A2BED8 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Samt1A2BED8 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Samt1A2BED8 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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