Protein–RNA interactions for Protein: A2AM80

Fam43b, Family with sequence similarity 43, member B, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Fam43bA2AM80 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Fam43bA2AM80 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Fam43bA2AM80 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Fam43bA2AM80 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Fam43bA2AM80 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam43bA2AM80 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam43bA2AM80 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Fam43bA2AM80 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Fam43bA2AM80 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam43bA2AM80 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam43bA2AM80 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam43bA2AM80 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam43bA2AM80 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Fam43bA2AM80 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam43bA2AM80 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Fam43bA2AM80 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Fam43bA2AM80 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam43bA2AM80 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam43bA2AM80 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam43bA2AM80 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam43bA2AM80 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam43bA2AM80 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam43bA2AM80 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam43bA2AM80 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam43bA2AM80 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam43bA2AM80 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam43bA2AM80 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam43bA2AM80 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam43bA2AM80 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam43bA2AM80 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam43bA2AM80 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam43bA2AM80 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam43bA2AM80 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam43bA2AM80 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms