Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ77

Prdm12, PR domain zinc finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm12A2AJ77 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms