Protein–RNA interactions for Protein: A2AGU5

Cldn34d, Claudin 34D, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34dA2AGU5 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34dA2AGU5 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34dA2AGU5 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34dA2AGU5 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34dA2AGU5 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34dA2AGU5 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34dA2AGU5 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34dA2AGU5 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34dA2AGU5 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34dA2AGU5 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34dA2AGU5 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34dA2AGU5 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34dA2AGU5 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34dA2AGU5 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34dA2AGU5 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34dA2AGU5 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34dA2AGU5 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34dA2AGU5 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34dA2AGU5 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34dA2AGU5 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34dA2AGU5 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34dA2AGU5 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34dA2AGU5 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34dA2AGU5 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34dA2AGU5 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34dA2AGU5 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34dA2AGU5 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34dA2AGU5 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34dA2AGU5 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34dA2AGU5 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34dA2AGU5 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34dA2AGU5 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34dA2AGU5 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34dA2AGU5 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34dA2AGU5 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34dA2AGU5 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34dA2AGU5 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34dA2AGU5 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34dA2AGU5 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34dA2AGU5 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34dA2AGU5 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34dA2AGU5 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34dA2AGU5 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34dA2AGU5 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34dA2AGU5 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34dA2AGU5 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34dA2AGU5 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34dA2AGU5 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34dA2AGU5 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34dA2AGU5 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34dA2AGU5 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34dA2AGU5 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34dA2AGU5 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34dA2AGU5 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34dA2AGU5 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34dA2AGU5 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34dA2AGU5 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34dA2AGU5 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34dA2AGU5 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34dA2AGU5 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34dA2AGU5 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34dA2AGU5 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34dA2AGU5 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34dA2AGU5 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34dA2AGU5 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34dA2AGU5 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34dA2AGU5 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34dA2AGU5 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34dA2AGU5 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34dA2AGU5 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34dA2AGU5 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34dA2AGU5 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34dA2AGU5 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34dA2AGU5 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34dA2AGU5 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34dA2AGU5 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34dA2AGU5 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34dA2AGU5 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34dA2AGU5 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34dA2AGU5 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34dA2AGU5 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34dA2AGU5 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34dA2AGU5 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34dA2AGU5 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34dA2AGU5 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34dA2AGU5 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34dA2AGU5 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34dA2AGU5 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34dA2AGU5 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34dA2AGU5 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34dA2AGU5 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34dA2AGU5 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34dA2AGU5 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34dA2AGU5 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34dA2AGU5 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34dA2AGU5 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34dA2AGU5 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34dA2AGU5 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34dA2AGU5 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34dA2AGU5 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms