Protein–RNA interactions for Protein: A2AGT5

Ckap5, Cytoskeleton-associated protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap5A2AGT5 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ckap5A2AGT5 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ckap5A2AGT5 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ckap5A2AGT5 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ckap5A2AGT5 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ckap5A2AGT5 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ckap5A2AGT5 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ckap5A2AGT5 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ckap5A2AGT5 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ckap5A2AGT5 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ckap5A2AGT5 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ckap5A2AGT5 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ckap5A2AGT5 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ckap5A2AGT5 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ckap5A2AGT5 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ckap5A2AGT5 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ckap5A2AGT5 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ckap5A2AGT5 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ckap5A2AGT5 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ckap5A2AGT5 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ckap5A2AGT5 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ckap5A2AGT5 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ckap5A2AGT5 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ckap5A2AGT5 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ckap5A2AGT5 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ckap5A2AGT5 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ckap5A2AGT5 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ckap5A2AGT5 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ckap5A2AGT5 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ckap5A2AGT5 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ckap5A2AGT5 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ckap5A2AGT5 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ckap5A2AGT5 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ckap5A2AGT5 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ckap5A2AGT5 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ckap5A2AGT5 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ckap5A2AGT5 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ckap5A2AGT5 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ckap5A2AGT5 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ckap5A2AGT5 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ckap5A2AGT5 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ckap5A2AGT5 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ckap5A2AGT5 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ckap5A2AGT5 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ckap5A2AGT5 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ckap5A2AGT5 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ckap5A2AGT5 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ckap5A2AGT5 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ckap5A2AGT5 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ckap5A2AGT5 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ckap5A2AGT5 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ckap5A2AGT5 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ckap5A2AGT5 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ckap5A2AGT5 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ckap5A2AGT5 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ckap5A2AGT5 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ckap5A2AGT5 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ckap5A2AGT5 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ckap5A2AGT5 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ckap5A2AGT5 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ckap5A2AGT5 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ckap5A2AGT5 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ckap5A2AGT5 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ckap5A2AGT5 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ckap5A2AGT5 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ckap5A2AGT5 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ckap5A2AGT5 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ckap5A2AGT5 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ckap5A2AGT5 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ckap5A2AGT5 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ckap5A2AGT5 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ckap5A2AGT5 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ckap5A2AGT5 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ckap5A2AGT5 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ckap5A2AGT5 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ckap5A2AGT5 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ckap5A2AGT5 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ckap5A2AGT5 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ckap5A2AGT5 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ckap5A2AGT5 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ckap5A2AGT5 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ckap5A2AGT5 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ckap5A2AGT5 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ckap5A2AGT5 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ckap5A2AGT5 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ckap5A2AGT5 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ckap5A2AGT5 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ckap5A2AGT5 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ckap5A2AGT5 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ckap5A2AGT5 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ckap5A2AGT5 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ckap5A2AGT5 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ckap5A2AGT5 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ckap5A2AGT5 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ckap5A2AGT5 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ckap5A2AGT5 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ckap5A2AGT5 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ckap5A2AGT5 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ckap5A2AGT5 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ckap5A2AGT5 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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