Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR2

4930447F04Rik, RIKEN cDNA 4930447F04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930447F04RikA2AFR2 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms