Protein–RNA interactions for Protein: A2ACT7

Col9a3, Collagen, type IX, alpha 3, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a3A2ACT7 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms