Protein–RNA interactions for Protein: A2AAE1

Kiaa1109, Uncharacterized protein KIAA1109, mousemouse

Predictions only

Length 5,005 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kiaa1109A2AAE1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Kiaa1109A2AAE1 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Kiaa1109A2AAE1 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Kiaa1109A2AAE1 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Kiaa1109A2AAE1 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Kiaa1109A2AAE1 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Kiaa1109A2AAE1 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Kiaa1109A2AAE1 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Kiaa1109A2AAE1 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Kiaa1109A2AAE1 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Kiaa1109A2AAE1 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Kiaa1109A2AAE1 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Kiaa1109A2AAE1 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Kiaa1109A2AAE1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Kiaa1109A2AAE1 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Kiaa1109A2AAE1 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Kiaa1109A2AAE1 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Kiaa1109A2AAE1 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Kiaa1109A2AAE1 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Kiaa1109A2AAE1 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Kiaa1109A2AAE1 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Kiaa1109A2AAE1 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Kiaa1109A2AAE1 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Kiaa1109A2AAE1 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Kiaa1109A2AAE1 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Kiaa1109A2AAE1 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Kiaa1109A2AAE1 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Kiaa1109A2AAE1 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Kiaa1109A2AAE1 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Kiaa1109A2AAE1 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Kiaa1109A2AAE1 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Kiaa1109A2AAE1 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Kiaa1109A2AAE1 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Kiaa1109A2AAE1 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Kiaa1109A2AAE1 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Kiaa1109A2AAE1 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Kiaa1109A2AAE1 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Kiaa1109A2AAE1 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Kiaa1109A2AAE1 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Kiaa1109A2AAE1 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Kiaa1109A2AAE1 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Kiaa1109A2AAE1 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Kiaa1109A2AAE1 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Kiaa1109A2AAE1 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Kiaa1109A2AAE1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Kiaa1109A2AAE1 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Kiaa1109A2AAE1 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Kiaa1109A2AAE1 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Kiaa1109A2AAE1 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Kiaa1109A2AAE1 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Kiaa1109A2AAE1 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Kiaa1109A2AAE1 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Kiaa1109A2AAE1 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Kiaa1109A2AAE1 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Kiaa1109A2AAE1 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Kiaa1109A2AAE1 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Kiaa1109A2AAE1 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Kiaa1109A2AAE1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Kiaa1109A2AAE1 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Kiaa1109A2AAE1 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Kiaa1109A2AAE1 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Kiaa1109A2AAE1 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Kiaa1109A2AAE1 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Kiaa1109A2AAE1 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Kiaa1109A2AAE1 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Kiaa1109A2AAE1 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Kiaa1109A2AAE1 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Kiaa1109A2AAE1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Kiaa1109A2AAE1 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Kiaa1109A2AAE1 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Kiaa1109A2AAE1 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Kiaa1109A2AAE1 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Kiaa1109A2AAE1 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Kiaa1109A2AAE1 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Kiaa1109A2AAE1 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
Kiaa1109A2AAE1 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Kiaa1109A2AAE1 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Kiaa1109A2AAE1 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Kiaa1109A2AAE1 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Kiaa1109A2AAE1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Kiaa1109A2AAE1 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Kiaa1109A2AAE1 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Kiaa1109A2AAE1 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Kiaa1109A2AAE1 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Kiaa1109A2AAE1 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
Kiaa1109A2AAE1 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Kiaa1109A2AAE1 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Kiaa1109A2AAE1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Kiaa1109A2AAE1 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
Kiaa1109A2AAE1 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Kiaa1109A2AAE1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Kiaa1109A2AAE1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Kiaa1109A2AAE1 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Kiaa1109A2AAE1 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Kiaa1109A2AAE1 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Kiaa1109A2AAE1 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Kiaa1109A2AAE1 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Kiaa1109A2AAE1 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Kiaa1109A2AAE1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Kiaa1109A2AAE1 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms