Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prdm16A2A935 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prdm16A2A935 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prdm16A2A935 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Prdm16A2A935 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Prdm16A2A935 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prdm16A2A935 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prdm16A2A935 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prdm16A2A935 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prdm16A2A935 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Prdm16A2A935 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Prdm16A2A935 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prdm16A2A935 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Prdm16A2A935 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prdm16A2A935 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prdm16A2A935 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prdm16A2A935 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prdm16A2A935 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prdm16A2A935 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prdm16A2A935 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prdm16A2A935 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prdm16A2A935 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prdm16A2A935 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prdm16A2A935 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prdm16A2A935 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prdm16A2A935 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prdm16A2A935 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prdm16A2A935 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prdm16A2A935 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prdm16A2A935 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prdm16A2A935 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prdm16A2A935 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prdm16A2A935 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prdm16A2A935 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prdm16A2A935 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prdm16A2A935 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prdm16A2A935 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prdm16A2A935 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prdm16A2A935 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prdm16A2A935 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Prdm16A2A935 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prdm16A2A935 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prdm16A2A935 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prdm16A2A935 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Prdm16A2A935 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prdm16A2A935 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Prdm16A2A935 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prdm16A2A935 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prdm16A2A935 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prdm16A2A935 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prdm16A2A935 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prdm16A2A935 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prdm16A2A935 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prdm16A2A935 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prdm16A2A935 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prdm16A2A935 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Prdm16A2A935 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prdm16A2A935 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prdm16A2A935 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prdm16A2A935 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Prdm16A2A935 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Prdm16A2A935 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Prdm16A2A935 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Prdm16A2A935 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prdm16A2A935 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prdm16A2A935 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prdm16A2A935 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Prdm16A2A935 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Prdm16A2A935 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prdm16A2A935 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prdm16A2A935 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prdm16A2A935 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prdm16A2A935 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prdm16A2A935 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prdm16A2A935 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prdm16A2A935 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prdm16A2A935 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prdm16A2A935 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prdm16A2A935 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prdm16A2A935 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prdm16A2A935 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prdm16A2A935 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prdm16A2A935 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prdm16A2A935 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prdm16A2A935 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prdm16A2A935 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prdm16A2A935 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prdm16A2A935 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prdm16A2A935 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Prdm16A2A935 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Prdm16A2A935 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prdm16A2A935 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Prdm16A2A935 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prdm16A2A935 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prdm16A2A935 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prdm16A2A935 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prdm16A2A935 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prdm16A2A935 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prdm16A2A935 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prdm16A2A935 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
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