Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtprfA2A8L5 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtprfA2A8L5 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PtprfA2A8L5 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtprfA2A8L5 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PtprfA2A8L5 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtprfA2A8L5 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PtprfA2A8L5 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtprfA2A8L5 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtprfA2A8L5 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtprfA2A8L5 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtprfA2A8L5 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtprfA2A8L5 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtprfA2A8L5 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtprfA2A8L5 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtprfA2A8L5 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtprfA2A8L5 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtprfA2A8L5 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PtprfA2A8L5 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtprfA2A8L5 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtprfA2A8L5 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtprfA2A8L5 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtprfA2A8L5 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtprfA2A8L5 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtprfA2A8L5 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtprfA2A8L5 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtprfA2A8L5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtprfA2A8L5 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtprfA2A8L5 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtprfA2A8L5 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtprfA2A8L5 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtprfA2A8L5 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtprfA2A8L5 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtprfA2A8L5 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtprfA2A8L5 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtprfA2A8L5 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtprfA2A8L5 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtprfA2A8L5 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprfA2A8L5 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprfA2A8L5 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprfA2A8L5 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprfA2A8L5 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprfA2A8L5 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprfA2A8L5 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprfA2A8L5 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprfA2A8L5 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprfA2A8L5 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprfA2A8L5 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprfA2A8L5 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprfA2A8L5 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprfA2A8L5 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprfA2A8L5 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprfA2A8L5 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprfA2A8L5 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprfA2A8L5 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprfA2A8L5 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprfA2A8L5 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprfA2A8L5 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprfA2A8L5 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprfA2A8L5 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprfA2A8L5 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprfA2A8L5 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprfA2A8L5 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprfA2A8L5 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtprfA2A8L5 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtprfA2A8L5 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtprfA2A8L5 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtprfA2A8L5 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtprfA2A8L5 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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PtprfA2A8L5 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtprfA2A8L5 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtprfA2A8L5 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtprfA2A8L5 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtprfA2A8L5 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtprfA2A8L5 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtprfA2A8L5 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtprfA2A8L5 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtprfA2A8L5 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtprfA2A8L5 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtprfA2A8L5 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtprfA2A8L5 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtprfA2A8L5 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtprfA2A8L5 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtprfA2A8L5 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtprfA2A8L5 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtprfA2A8L5 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtprfA2A8L5 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtprfA2A8L5 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PtprfA2A8L5 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PtprfA2A8L5 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtprfA2A8L5 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtprfA2A8L5 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtprfA2A8L5 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtprfA2A8L5 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtprfA2A8L5 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtprfA2A8L5 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtprfA2A8L5 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtprfA2A8L5 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtprfA2A8L5 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms