Protein–RNA interactions for Protein: A2A432

Cul4b, Cullin-4B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 970 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul4bA2A432 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Cul4bA2A432 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cul4bA2A432 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cul4bA2A432 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cul4bA2A432 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cul4bA2A432 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cul4bA2A432 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cul4bA2A432 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cul4bA2A432 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cul4bA2A432 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cul4bA2A432 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cul4bA2A432 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cul4bA2A432 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cul4bA2A432 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Cul4bA2A432 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Cul4bA2A432 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Cul4bA2A432 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cul4bA2A432 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cul4bA2A432 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cul4bA2A432 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cul4bA2A432 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cul4bA2A432 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cul4bA2A432 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cul4bA2A432 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cul4bA2A432 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cul4bA2A432 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cul4bA2A432 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cul4bA2A432 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cul4bA2A432 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cul4bA2A432 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Cul4bA2A432 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cul4bA2A432 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cul4bA2A432 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cul4bA2A432 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cul4bA2A432 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cul4bA2A432 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cul4bA2A432 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cul4bA2A432 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cul4bA2A432 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cul4bA2A432 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cul4bA2A432 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cul4bA2A432 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cul4bA2A432 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cul4bA2A432 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cul4bA2A432 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cul4bA2A432 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cul4bA2A432 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cul4bA2A432 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cul4bA2A432 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cul4bA2A432 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cul4bA2A432 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cul4bA2A432 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cul4bA2A432 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cul4bA2A432 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cul4bA2A432 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cul4bA2A432 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cul4bA2A432 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cul4bA2A432 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cul4bA2A432 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Cul4bA2A432 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cul4bA2A432 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cul4bA2A432 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cul4bA2A432 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cul4bA2A432 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Cul4bA2A432 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cul4bA2A432 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Cul4bA2A432 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Cul4bA2A432 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Cul4bA2A432 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cul4bA2A432 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cul4bA2A432 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cul4bA2A432 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cul4bA2A432 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cul4bA2A432 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cul4bA2A432 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cul4bA2A432 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cul4bA2A432 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cul4bA2A432 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cul4bA2A432 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cul4bA2A432 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cul4bA2A432 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cul4bA2A432 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cul4bA2A432 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cul4bA2A432 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cul4bA2A432 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cul4bA2A432 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cul4bA2A432 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cul4bA2A432 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cul4bA2A432 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cul4bA2A432 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cul4bA2A432 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cul4bA2A432 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cul4bA2A432 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cul4bA2A432 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cul4bA2A432 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Cul4bA2A432 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cul4bA2A432 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cul4bA2A432 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Cul4bA2A432 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cul4bA2A432 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms