Protein–RNA interactions for Protein: A0N8N6

Trav12-2, T cell receptor alpha variable 12-2 (Fragment), mousemouse

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav12-2A0N8N6 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Trav12-2A0N8N6 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Trav12-2A0N8N6 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Trav12-2A0N8N6 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Trav12-2A0N8N6 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Trav12-2A0N8N6 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Trav12-2A0N8N6 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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