Protein–RNA interactions for Protein: A0A0R4J054

4921501E09Rik, RIKEN cDNA 4921501E09, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921501E09RikA0A0R4J054 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms