Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP7

Gm3238, MCG61407, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3238W4VSP7 Gm15130-201ENSMUST00000132464 663 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Gm20854-201ENSMUST00000178889 1002 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Gm43037-201ENSMUST00000196808 250 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
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Gm3238W4VSP7 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Sult3a1-202ENSMUST00000218204 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Ipcef1-202ENSMUST00000086896 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Sult3a1-201ENSMUST00000092597 1047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Gm3238W4VSP7 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Gm3238W4VSP7 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Gm3238W4VSP7 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Gm3238W4VSP7 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Gm3238W4VSP7 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Gm3238W4VSP7 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Gm3238W4VSP7 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Gm3238W4VSP7 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Gm3238W4VSP7 Olfr183-204ENSMUST00000214831 1906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Esp18-201ENSMUST00000179848 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Gm26693-201ENSMUST00000181318 1021 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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