Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms