Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q5

Mrpl40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, mousemouse

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Length 206 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl40Q9Z2Q5 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Mrpl40Q9Z2Q5 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Mrpl40Q9Z2Q5 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Mrpl40Q9Z2Q5 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Mrpl40Q9Z2Q5 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Mrpl40Q9Z2Q5 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Mrpl40Q9Z2Q5 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Mrpl40Q9Z2Q5 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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