Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms